Para anular uma factura nos programas B-Online basta seleccionar a opção "Consultar Factura" no menu principal e pesquisar a factura emitida que se pretende anular.
Após identificada a factura a anular e clicando em "mais opções", o utilizador deverá seleccionar a opção anular.
Nota: Se a licença tiver comunicação automática de facturas para a Autoridade Tributária, não é permitida por lei a anulação de facturas. Nestas situações, a regularização deve ser feita por via da emissão de um documento rectificativo (nota de crédito ou nota de débito).